En diciembre de 2005, la Comisión Nacional de Acreditación de Pregrado (CNAP), antecesora de la actual Comisión Nacional de Acreditación-Chile (CNA-Chile), acordó acreditar institucionalmente a la Universidad Mayor por un periodo de cuatro años, en un proceso que focaliza tanto en el área de Gestión Institucional como en el de Docencia de Pregrado.

La Rectoría de la institución ha expresado su satisfacción por este logro, resaltando que “ratifica la rigurosidad del trabajo de autoevaluación permanente que hemos desarrollado, y que hemos fortalecido con nuestra integración de someternos también a una acreditación internacional ante un organismo oficial de los EE.UU., lo que constituye un desafío de altísima exigencia y rigurosidad”.

Con la acreditación nacional, los alumnos que postulan a la Universidad Mayor tienen derecho a optar al crédito con aval del Estado, lo que abre la oportunidad de estudiar en esta casa de estudios.

Cabe señalar que la Universidad Mayor ha mantenido los diversos beneficios y créditos internos ofrecidos a sus alumnos, que otorga tanto a sus actuales estudiantes como a quienes se integrarán cada año.

La UM incursiona igualmente en la acreditación de carreras o programas. Es así que recientemente (2008) ha recibido la acreditación por parte de la Comisión Nacional de Acreditación-Chile de la Carrera de Enfermería y de Odontología, siendo en este caso la primera en hacerlo en el concierto de universidades privadas. En 2007 le fue otorgada la acreditación de la Carrera de Medicina, tanto en el plano nacional como en el Sistema Mercosur de aseguramiento de la calidad, lo que constituye un logro en este último caso pues es también la primera entre las escuelas de medicina.